Gestructureerd grondig schoonmaken is noodzakelijk om komkommerbontvirus uit te bannen. Delphy heeft een hygiëneprotocol opgesteld voor schoonmaak en desinfectie van kassen.
Telers zijn gewend hun kas goed schoon te maken tijdens de teeltwisseling. Toch lukt het de een om dat heel secuur te doen, waarna probleemloos virusvrij geteeld kan worden. Er zijn echter ook telers waarbij succesvol ontsmetten van de kas uitblijft.